當公司收到金流後，有開出發票給客戶，會產生「銷項稅額」；支出金流收到的發票則是會產生「進項稅額」，使用NexTrek不需特別計算這些稅額，只要開啟營業稅的快速鍵，系統就會自動建立分錄，而您可以至資產負債表看到這兩個項目的金額。
每兩個月會依照銷項稅額、進項稅額的差異來決定是否需繳納營業稅，或產生留抵稅額，那以下我們分兩個部分說明如何操作：
（註：因實際申報狀況不一定會與NexTrek相符，操作時建議以申報書上的金額為準）
情境1：「銷項稅額」＞「進項稅額」（要繳稅）
1.
確認申報書上需繳納的金額，並核對金流紀錄「支出」，原因選擇「繳納營業稅」。
2.
此筆交易系統會自動在借方產生銷項稅額，沖銷後的銷項稅額＝進項稅額。
3.
新增一筆手動分錄（左方「會計」＞「傳票建立-傳票建立」），輸入借方2290-銷項稅額，貸方1290-進項稅額，金額填入申報書上進項稅額的金額。
4.
操作完成，回到資產負債表，確認已結清本期銷項與進項稅額。
情境2：「銷項稅額」＜「進項稅額」（不用繳稅）
1.
依照申報書上銷項稅額的金額建立一組分錄（左方「會計」＞「傳票建立-傳票建立」），借方2290-銷項稅額，貸方1290-進項稅額。
2.
操作完成，銷項稅額沖銷後剩餘的「進項稅額」即是留抵稅額，可留至下一期使用。
參考文章：哪些發票不能申報營業稅？、營業稅快速鍵、